Dr. Öğr. Üyesi
Özlem Ulucan Açan
Eğitim
- Doçentlik Ünvanı, 2026. Biyomühendislik, Üniversitelerarası Kurul.
- Doktora, 2015. Biyoinformatik, Biyoinformatik Merkezi, Saarland Üniversitesi, Saarbrücken, Almanya.
- Yüksek Lisans. 2009. Hesaplamalı Bilimler ve Mühendislik, Koç Üniversitesi, İstanbul, Türkiye.
- Lisans, 2007. Moleküler Biyoloji ve Genetik, İstanbul Üniversitesi, İstanbul, Türkiye.
- Erasmus Değişim Programı, 02.2006 – 08.2006. Groningen Üniversitesi, Hollanda.
- Çift Anadal (non-degree), 2005-2007. Matematik, İstanbul Üniversitesi, İstanbul, Türkiye.
Verdiği Dersler
- BIOE 341: Bioinformatik
- BIOE 340: Biyomühendislikte Modelleme ve Simülasyon
- BIOE 510: Biyomühendislikte Araştırma Yöntemleri ve Etik
- BIOE 541: Biyoinformatik ve İşlevsel Genomik
- BIOE 557: Biyomühendislikte İstatistiksel ve Hesaplamalı Yöntemler
İlgi Alanları
- Hesaplamalı Sistem Biyolojisi ve Çoklu-Omik Entegrasyonu: Büyük ölçekli biyolojik verilerin (transkriptomik, proteomik vb.) entegrasyonu ve analizi.
- Makine Öğrenmesi ve Yapay Zeka: Biyomedikal veriler üzerinde Çizge Sinir Ağları ve açıklanabilir yapay zeka uygulamaları.
- Kanser Biyolojisi ve Hassas Tıp: Mide, meme ve akciğer kanserlerinde Ferroptozis ve EMT (Epitelyal-Mezenkimal Geçiş) süreçlerinin moleküler mekanizmaları.
- İlaç Yeniden Konumlandırma : Mevcut ilaçların yeni terapötik endikasyonlar için hesaplamalı yöntemlerle taranması ve validasyonu.
- Bilgisayar Destekli İlaç Tasarımı ve Farmakogenomik: Protein-protein etkileşimlerinin modellenmesi, yan etki öngörüsü ve yeni terapötik hedeflerin belirlenmesi.
Diğer Bilgiler
Projeler
- Üçlü-negatif meme kanserinde epitelyal-mezenkimal geçiş ve ferroptoz arasındaki etkileşimin araştırılması ve bu etkileşimin yeni tedavi kombinasyonları için kullanımının değerlendirilmesi. Yürütücü, TÜBİTAK 1001 (2026– )
- Kanser hücrelerinde hibrit epitel-mezenkimal geçiş durumlarının karakterizasyonu ve bu hibrit durumları hedefleyen ilaç adayı moleküllerin belirlenmesi. Yürütücü, TÜBİTAK 3501 (2022– )
- Ph-like alt tipini tanımlamak için akut lenfoblastik löseminin yolak bazlı sınıflandırması. Yürütücü, İstanbul Bilgi Üniversitesi (2022–2023)
- Yeni tanı almış akut lenfoblastik lösemi hastalarının RNA dizileme analizleri ile risk sınıflandırması. Araştırmacı, İstanbul Üniversitesi (2021–2023)
- Baskılayıcı immün denetim noktalarını hedef alan anti-kanser ilaç tasarımı. Yürütücü, İstanbul Bilgi Üniversitesi (2018–2020)
- Spesifik, geçici ve non-spesifik protein–protein etkileşimlerinin oluşumunda arayüzey suyunun rolü. Araştırmacı, DFG/Almanya, (2012–2015)
- Q-HOP moleküler dinamikleri kullanılarak dekore edilmiş yüzeylerde ve sitokrom c oksidazda proton taşınımının simülasyonu. Araştırmacı, DFG/Almanya (2009–2012)